Ο Μάρκο Ρότα έχει σχεδιάσει διάφορους χαρακτήρες αλλά και εξώφυλλα! Ο Ρότα έχει εμπνευστεί από τον Καρλ Μπαρκς, τον Αλ Ταλιαφέρρο, το Φλόυντ Γκότφρεντσον και τον Πωλ Μάρρυ. Έχει ένα χαρακτηριστικό τρόπο να σχεδιάζει. Αυτό είναι πιο εύκολα αντιληπτό από τον τρόπο που σχεδιάζει το κεφάλι του Ντόναλντ, τις πόλεις και τα πάνελ.
Ο Μάρκο Ρότα έχει το δικό του τρόπο σχεδιασμού του κεφαλιού του Ντόναλντ. Το καπέλο του Ντόναλντ σχεδιάζεται στα πλάγια του πάνω μέρους του κεφαλιού, σε αντίθεση με τον Ντόναλντ των περισσότερων σχεδιαστών. Στις ιστορίες του Ρότα με τον Άντολντ τον Ανήμερο, έχει βάλει ένα μικρό κεφάλι πάνω στο κράνος του Άντολντ- το οποίο μιμείται τα συναισθήματα του Άντολντ. Όταν ο Άντολντ είναι θυμωμένος, έτσι είναι και το κεφάλι στο κράνος, και όταν ο Άντολντ μιλά, μιλά και το κεφάλι.
Ένας τρόπος για να αναγνωρίζει κανείς τις ιστορίες του Ρότα είναι να παρατηρεί τον τρόπο με τον οποίο σχεδιάζει τα καρέ. Φαίνεται ότι στο Ρότα δεν αρέσει να κάνει σταθερά καρέ. Στις πιο καινούριες ιστορίες του, βρίσκουμε καρέ καμπυλωμένα σε μία ή αρκετές πλευρές. Σε μια δεκασέλιδη ιστορία, υπάρχουν συνήθως πολλά τέτοια καρέ.
Όταν του δίνεται η ευκαιρία, ο Ρότα τοποθετεί μικρές, αστείες λεπτομέρειες στις ιστορίες του, όπως ένα πουλί που φοράει καπέλο σαν του Ντόναλντ, αφίσες που υποδεικνύουν άλλες ιστορίες του, ονόματα φίλων ή κολεγίων κτλ.
Ο Ρότα υπογράφει ή βάζει τα αρχικά του στις ιστορίες του. Στη Νύχτα των Σαρακηνών, βρίσκουμε τα ονόματα αρκετών εκδοτών του Topolino και κάποιες φορές βρίσκουμε την υπογραφή "Marks". O Μάρκο Ρότα άρχισε να κάνει την υπογραφή του, αφότου είδε μια εικόνα με την αφιέρωση "Για το Μάριο Τζεντιλίνι, Καρλ Μπαρκς".